Nas análises quantitativas a AgroGenética utiliza a técnica de PCR em Tempo Real por meio da metodologia TaqMan®, o método mais aceito internacionalmente para esta finalidade. A PCR em Tempo Real é descrita como quantitativa porque consegue realizar a avaliação do número de moléculas de ácidos nucléicos produzidas a cada ciclo. O método detecta e quantifica, de modo específico, sequências de DNA do promotor 35S CaMV que está presente na maioria dos eventos de OGMs comercializados até o momento. O procedimento é extremamente preciso devido à perfeita complementaridade entre os primers e as sondas TaqMan® usados na reação de PCR e as sequências alvo de DNA que estão sendo amplificadas. As reações são realizadas utilizando simultaneamente a curva de calibração com padrões de referência certificados que variam normalmente de 0,1 a 5,0% de farinha do material GM com farinha do material não GM da espécie em questão. Esta metodologia permite definir qual o percentual de transgênicos na amostra em análise, podendo detectar uma contaminação na ordem de 0,1%. Amostras cujo resultado apresente contaminação menor do que 0,1% de transgênicos são classificadas como negativas.